马昕教授长期投身于骨科足踝外科临床一线工作及科学研究工作。在国内及国际上率先提出“三维截骨技术治疗足部复杂畸形”的治疗理念，已推广应用于国内30余家二级及三级医院。共发表相关学术论文与临床专著160余篇，其中SCI论文76篇。近15年积累了各类足踝常见及罕见病例共计1万余例，是目前国内最大的足踝病例数据库。相关成果获上海市医学科技奖二等奖、推广奖及中华医学科技奖等省部级科技奖励5项。创建国内领先的医工结合团队，团队共拥有医科人员及医学工程研究人员40余人，已申请国家发明专利20余项。牵头制定多项足踝疾病全国专家治疗共识，牵头2022年国家重点研发计划“老年人足部辅具设计、制造和评测关键技术与系统研究”，主持国家自然科学基金项目4项，主持省部级科研项目5项。 马昕教授担任中华医学会骨科分会足踝外科医师培训中心主任，该中心在国内首创足踝应用解剖与手术技术培训教育模式。已主办14届国家级“足踝外科应用解剖系列培训课程”及30余场足踝培训课程，累计培训临床专科医师近8000人次，2019年主办了中美足踝菁英论坛，推动了我国足踝专业人才教育事业的发展。